მას შემდეგ, რაც hellish კარიბჭე უკვე მოახერხა ჩაკეტვა, მაგრამ ბოროტი ალკოჰოლური სასმელების არ დატოვა იმედი გასათავისუფლებლად მათი გზა კიდევ ერთხელ და ისინი წარმატებით შემდეგ მრავალი წლის განმავლობაში. ამჯერად მათ გახსნეს პორტალი მარსზე, იმ იმედით, რომ ადამიანები ვერ პოულობდნენ დაუყოვნებლივ. მაგრამ მარსმა უკვე კოლონიზაცია მოახდინა, მასზე მრავალი ბიოლოგიური ლაბორატორიები დასახლდნენ და მეცნიერების მასა, რომლებიც მუშაობენ, ყველა მათგანი მონსტრიდან სასტიკად დატეხილია. შენი sweeping გუნდი უნდა გაანადგუროს მონსტრები Doom 3 და თქვენ არ უნდა მიიღოს გამოცდილება. გადასვლა წითელი პლანეტის და ფრთხილად, მონსტრები გახდა სასურველი სტუმარი გახდებით და უფრო ძლიერი.