შორეულ საოცარ სამყაროში ცხოვრობენ ისეთი არსებები, როგორიცაა Pokemon. ისინი იყოფა ჯგუფებად, რომლებიც თაყვანს სცემენ ბუნების სულებს. ერთხელ ცეცხლისა და წყლის სულების თაყვანისმცემლებმა ჩაატარეს რიტუალი და ამ ღვთაებრივი პირები ამ სამყაროში გამოიძახეს. მაგრამ ისინი ძალიან ბოროტი სულები აღმოჩნდნენ და კონტროლიდან გამოვიდნენ. ახლა მთელი პლანეტა ქაოსშია და ბუნებრივი კატასტროფები მუდმივად ხდება. თქვენ თამაშში Pokemon Emerald Version მოუწევთ მათთან ბრძოლა. თქვენს წინაშე ეკრანზე ნახავთ გარკვეულ ადგილს, რომელშიც თქვენი პერსონაჟები განთავსდებიან. ისინი თავს დაესხმიან მაგალითად ცეცხლის სულს. თქვენ მიმართავთ მათ მოქმედებებს სპეციალური პანელის გამოყენებით. მისი დახმარებით თქვენ აიძულებთ თქვენს პოკემონებს გამოიყენონ სხვადასხვა მაგიური შელოცვები, რომლითაც ისინი ზიანს აყენებენ მოწინააღმდეგეს.
