ჯუნგლების სიღრმეში ცხოვრობს გორილა სახელად ვირი, რომელიც ყოველთვის ეხმარება თავის მეგობრებს. ერთხელ ჩვენმა პერსონაჟმა გადაწყვიტა წასულიყო მისი შორეული ნათესავების მოსანახულებლად, რომლებიც ცხოვრობენ ჯუნგლების მეორე მხარეს. თქვენ თამაშში Super Donkey Kong 99 მოგიწევთ დაეხმაროთ გმირს ამ თავგადასავალში. თქვენი პერსონაჟი გამოჩნდება თქვენს თვალწინ ეკრანზე, რომელიც, თქვენი ხელმძღვანელობით, წინ მიიწევს გზაზე, თანდათან ამაღლებს სიჩქარეს. გზად, თქვენს პერსონაჟს მოუწევს შეაგროვოს ყველგან მიმოფანტული ბანანი და ოქროს მონეტები. მას ასევე მოუწევს გადალახოს სხვადასხვა ხაფანგები და დაბრკოლებები, რომლებიც მის გზაზე წავა.
