აპოკალიფსი შეიძლება მოხდეს სხვადასხვა მიზეზის გამო, თამაშში Apocalypse Run თქვენ დაეხმარებით გმირს, რომელიც იმყოფებოდა აპოკალიფსის ცენტრში, რომელიც გამოჩნდა მანქანების აჯანყების შედეგად. ხელოვნურმა ინტელექტმა, რომლის გამოჩენასაც ასე ელოდნენ და ასე აღფრთოვანებული იყო მისი სწრაფი განვითარების გამო, გადაწყვიტა, რომ ახლა მას არ სჭირდება ხალხი. უფრო მეტიც, ისინი საზიანოც კი არიან, რადგან ყველაფერს არასწორად აკეთებენ, ხშირად იქცევიან არაგონივრულად, ანგრევენ გარემოს და კლავენ საკუთარ გვარს. მანქანის გონებაში ჩამოყალიბდა ძლიერი რწმენა, რომ ადამიანი არის მთავარი ბოროტება პლანეტაზე და უნდა განადგურდეს. ასე დაიწყო კაცობრიობის სისტემატური განადგურება და Apocalypse Run-ის გმირს სურს ამის თავიდან აცილება და თქვენ დაეხმარებით მას რობოტებთან ბრძოლაში.
