იაპონიაში მაფიას ჰქვია იაკუზა და არის ძალიან სერიოზული კრიმინალური ორგანიზაცია, რომელიც მოქმედებს კანონის მიღმა საკუთარი წესებით. თუ მას რაიმე სჭირდება, ის იღებს მას, განურჩევლად მათი ცხოვრებისა და საჭიროებებისა, ვინც მათ გზაზე დგას. Samurai vs Yakuza წარმოგიდგენთ სამურაის, რომელსაც სურს გადაარჩინოს თავისი სოფელი. ბანდიტებს მოეწონათ იგი უძველესი ტაძრის გამო, რომელიც მის ტერიტორიაზე მდებარეობს. ამ ტაძარში არის რამდენიმე ძვირფასი ფიგურა, რომელთა ფლობა სურდა იაკუზას უფროსს. ჩვენი გმირი მთელი მაფიის არმიის გზაზე დადგა და თქვენი დახმარებით მოიგერიებს შავხალათიანი მძარცველების თავდასხმას სამურაი იაკუზაში.
