ამ ბოლო დროს სოკოს სამეფო წყნარად და მშვიდად იყო, პრინცესა ატამიც კი არავის გაუტაცებია. ერთის მხრივ, ეს სიამოვნებს სანტექნიკოს მარიოს, მეორეს მხრივ კი ამშვიდებს მას. ბოროტმოქმედი ბოუსერიც კი იმალება. თამაშში Run Mario Run, მარიომ გადაწყვიტა დაეწყო ყოველდღე სირბილი, რათა დარჩეს ფორმა და მოემზადოს ნებისმიერი შემთხვევისთვის. ბოუზერი შოკში ჩავარდა და მან მაშინვე განათავსა თავისი მხლებლები ყველა გზაზე, რომ სანტექნიკოსი გაეფუჭებინა. დაეხმარეთ გმირს ოსტატურად გადალახოს დაბრკოლებებსა და პატარა ბოროტმოქმედებს Run Mario Run-ში.
