მამაცი ნინძა მეომარი შევიდა უძველეს დუნდულში. ჩვენს გმირს მოუწევს მისი შესწავლა და შეაგროვოს ყველა ოქროს ჯადოსნური მონეტა. თქვენ თამაშში Ninja Auto Run დაეხმარებით მას ამ თავგადასავალში. სანამ ეკრანზე დაინახავთ დუნდონის ერთ-ერთ ოთახს. თქვენი გმირი მასზე გარკვეული სიჩქარით გაიქცევა. მის გზაზე გამოჩნდება მიწიდან გამოსული მწვერვალები, სხვადასხვა სიმაღლის დაბრკოლებები და სხვა ხაფანგები. როდესაც თქვენი გმირი ამ საფრთხის წინაშე აღმოჩნდება, თქვენ მოგიწევთ მათ გადახტომა. ამ გზით თქვენი ნინძა გაივლის ყველა ამ საფრთხეს. გზად დაეხმარეთ პერსონაჟს ოქროს მონეტების შეგროვებაში, რისთვისაც მოგეცემათ ქულები Ninja Auto Run თამაშში.