Mole Kingdom მშვიდობიანად არსებობდა ტყის პირას და არავის აწუხებდა, მაგრამ Mole Kingdom Defense-ის ერთ მომენტში მას მოუწია მთელი ტყის მფარველად გადაქცევა, რადგან სამეფო საზღვარზე მდებარეობს. მშვიდობიანი ცხოვრება დასრულდა, როდესაც ტყეს თავს დაესხნენ მონსტრები: ფრენა, ცოცვა და სირბილი. პირველი დარტყმა მოლაშქრე მესაზღვრემ მიიღო, მაგრამ მალე მის დასახმარებლად მოგვს, მშვილდოსანს და შუბოსანს მიიყვანთ. ისინი დაიცავენ თავიანთ საზღვრებს და არ დაუშვებენ მტერს გავლას. ბრძოლის დროს განახლებების არჩევანი თქვენზეა დამოკიდებული. თავდასხმების ყოველი ტალღის ბოლოს გამოჩნდება ბოსი, რომლის განადგურებაც ადვილი არ არის Mole Kingdom Defense-ში.